Le bâtiment a été édifié à la fin du XVIe siècle et a été consacré en tant qu’église mère en 1621.
L’église de Santa Margherita (Sainte-Marguerite) a été endommagée par le tremblement de terre de 1693, mais a ensuite été reconstruite et ouverte en 1738 par l’évêque de Syracuse Matteo Trigona.
En 1867, cette église était la seule à rester ouverte pour les célébrations religieuses, maintenant ses portes ouvertes pendant une épidémie de choléra qui s’était répandue dans la région.
En 1893, la construction de l’escalier reliant la place a été réalisée par l’ingénieur Antonino Astuto.
Le plan est conçu selon un modèle basilical en forme de croix latine, comprenant trois nefs et une abside rectangulaire.
La nef centrale, voûtée en berceau, est couverte d’une structure en bois ornée d’un appareil en stuc de roseaux et de plâtre.
La façade, de style baroque tardif, présente un fond scénographique composé de deux ordres superposés, dont celui du haut est incomplet.
Dans la partie centrale, on peut observer les armoiries héraldiques de la famille Santa Pau ainsi que quelques éléments allégoriques.
Le clocher de l’église est très imposant, comme mentionné dans le roman « Jeli il pastore » de l’écrivain de Catane Giovanni Verga.
